下肢静脉曲张的微创化治疗、血管瘤的综合治疗、透析用动静脉内瘘的建立和并发症的处理、血管疾病的超声诊断
林晓曦教授在血管瘤与脉管畸形及疑难体表肿瘤领域具有较深的造诣，对血管瘤和脉管畸形、先天性黑色素痣、各类胎记及神经纤维瘤治疗等方面在国内外均处于领先水平。完成了包括《黄家驷外科学》等30多部多学科专著的编著。在血管瘤与脉管畸形领域，自1993年开始集中研究，2004年组建血管瘤专业，把颅面外科、显微外科、介入治疗、激光、美容等技术熟练应用于个例的治疗，形成中国特色的整形外科团队，以及16个学科的MDT团队，成为国际上病例最集中的单一中心，能完成国际上最疑难的该疾病的手术和治疗，成功救治国际同行转诊的疑难患者。临床及研究方面在亚洲形成了领先的影响力，带领多学科专家共同完成了高引用率的血管瘤与脉管畸形诊疗指南。林晓曦教授在国际上首先报道或处于领先水平的研究包括：新血管瘤类型TECH；在血管瘤方面提出血清学标志物及VEGF等多种新标志物、缺氧及相关诱导因素，普萘洛尔停药及门诊治疗指征、外用药研发；动静脉畸形的早期新治疗、早期诊断、血管构筑学、国内无水乙醇血管内治疗和多项新技术；静脉畸形的新药开发，低浓度灌注麻醉法，早期激光治疗阻抑方法；同时及时向国内首先介绍NICH、RICH、PICH等先天性血管瘤及PROS、CLOVES等综合征；近来在国际或亚洲首先使用血管瘤原始细胞来源研究技术、血管畸形相关导航、神经介入、遗传学与靶向治疗等创新技术。在遗传学与靶向治疗领域有多项进展，成为欧美以外的主要研究中心，对引领东亚的领域发展和提供东亚人种的遗传数据作出了贡献。林晓曦教授在面部整形美容与年轻化方面积累了丰富的经验，对面部美容与重建手术有着强烈的兴趣，把美学和科学证据融合到创新实践中。在重建外科方面，首先报道了改进传统梭形切除的“梳子瓣”技术、修复眼睑分裂痣等眼周缺损的PEPSI术式、全颏重建新方法、基于颞浅血管和筋膜的预构面部扩张、单次纵向大面积切除、头皮撕脱伤受区颞中静脉选择等；在美容外科方面，应用肉毒毒素防治面部切口瘢痕、“斜拉桥”面部除皱术、经口内引出的内切口眶脂重置、钝针上睑局麻、步序法等几种新内眦开大法、肋软骨支架结合碎软骨鼻美容等术式，部分术式在国际和国内已开始应用。在面部年轻化领域，是各类面部年轻化手术和激光光电等非手术治疗的实践者，并提出不同治疗方法的适应证。 在激光医学方面，林晓曦教授是国内整形外科领域最早的激光美容领域开拓者之一，在国际上首次采用英文报道葡萄酒色斑光动力学治疗、最早的远期随访及病理、对脉冲染料激光抵抗病例的治疗结果等；在脉冲染料激光治疗葡萄酒色斑领域，针对光热作用有效病例的病理基础、次数预测、周期缩短、双波长适应证等发表了一系列证据等级较高的研究结论；在美容领域，提出减少毛孔的新疗法、激光治疗血管性黑眼圈等原创方法。加强了全国学会各学科激光美容学术建设和多中心临床研究的部署和发展，开设了大学的激光医学研究生教程。
血管瘤、淋巴管瘤及血管畸形的微创介入治疗、儿童肿瘤介入栓塞化疗、肾动脉狭窄及食管狭窄的球囊扩张、出血性疾病的血管造影诊断及栓塞治疗。
1.儿童血管瘤的综合治疗2.淋巴管瘤及血管畸形的不开刀微创精准介入治疗3.常见先天性心脏病的微创封堵治疗及疑难复杂先天性心脏病的诊断和手术治疗
擅长儿童血管瘤、血管畸形、淋巴管畸形口服药物、介入手术等综合治疗，为患儿量身打造个体化治疗方案，以及儿童食道狭窄球囊扩张、儿童肾动脉狭窄球囊扩张、儿童咯血、肝血管瘤及肝母细胞瘤等的介入微创治疗，尤其擅长儿童视网膜母细胞瘤的介入治疗，处于国内领先水平。
血管疾病如血管瘤，下肢静脉曲张，下肢深静脉血栓，动脉血栓，血栓闭塞性脉管炎，下肢动脉硬化闭塞症，动脉外伤，等血管疾病，尤其对于颅外颈动脉狭窄导致的脑梗塞及脑灌注不足。
外周动脉疾病（老烂脚、老寒腿、糖尿病足、下肢动脉硬化闭塞、血栓闭塞性脉管炎、颈动脉狭窄、肾动脉狭窄、肠系膜动脉栓塞等）；外周静脉疾病（下肢静脉曲张、静脉血栓、血栓后遗症、易栓症等）；主动脉疾病（主动脉夹层、胸主动脉瘤、腹主动脉瘤、主动脉缩窄等）；血管畸形（静脉畸形、动静脉畸形等）
烧伤、 烧烫伤、 手足畸形矫形、颅面畸形矫正、色素痣、体表软组织肿块、 瘢痕、 血管畸形、淋巴管瘤等烧伤整形科相关疾病
头颈部肿瘤的诊断和治疗，尤其是对血管瘤、脉管畸形的治疗有丰富的经验和较深的学术造诣